Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRCC1Q9C099 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRCC1Q9C099 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRCC1Q9C099 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms