Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS26

ERP44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP44Q9BS26 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERP44Q9BS26 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ERP44Q9BS26 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERP44Q9BS26 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERP44Q9BS26 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms