Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TM2D3Q9BRN9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TM2D3Q9BRN9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms