Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BPIFA3Q9BQP9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BPIFA3Q9BQP9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms