Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP19Q99542 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP19Q99542 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms