Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
EYA3Q99504 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EYA3Q99504 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EYA3Q99504 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms