Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CRAMP1Q96RY5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
CRAMP1Q96RY5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CRAMP1Q96RY5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms