Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHF12Q96QT6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms