Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ALS2CR12Q96Q35 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ALS2CR12Q96Q35 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms