Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RILPQ96NA2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RILPQ96NA2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms