Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC136Q96JN2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC136Q96JN2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC136Q96JN2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms