Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIN37Q96GY3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIN37Q96GY3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms