Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
BCANQ96GW7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
BCANQ96GW7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
BCANQ96GW7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms