Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PGBD4Q96DM1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGBD4Q96DM1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PGBD4Q96DM1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms