Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MKL1Q969V6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MKL1Q969V6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MKL1Q969V6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms