Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNFRSF25Q93038 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFRSF25Q93038 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms