Protein–RNA interactions for Protein: Q92834

RPGR, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRQ92834 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RPGRQ92834 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RPGRQ92834 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms