Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXB13Q92826 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXB13Q92826 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms