Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWW8

GAB3, GRB2-associated-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAB3Q8WWW8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAB3Q8WWW8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GAB3Q8WWW8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms