Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFT2D1Q8WV19 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFT2D1Q8WV19 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms