Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACTRT1Q8TDG2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACTRT1Q8TDG2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACTRT1Q8TDG2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms