Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MDM1Q8TC05 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MDM1Q8TC05 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms