Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBA3Q8TBC4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBA3Q8TBC4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms