Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP2Q8ND30 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP2Q8ND30 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP2Q8ND30 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP2Q8ND30 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP2Q8ND30 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP2Q8ND30 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP2Q8ND30 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP2Q8ND30 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP2Q8ND30 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP2Q8ND30 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP2Q8ND30 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPFIBP2Q8ND30 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIBP2Q8ND30 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIBP2Q8ND30 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIBP2Q8ND30 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIBP2Q8ND30 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIBP2Q8ND30 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIBP2Q8ND30 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIBP2Q8ND30 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIBP2Q8ND30 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIBP2Q8ND30 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIBP2Q8ND30 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIBP2Q8ND30 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIBP2Q8ND30 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIBP2Q8ND30 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPFIBP2Q8ND30 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPFIBP2Q8ND30 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms