Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GJD3Q8N144 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms