Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
VSIG10Q8N0Z9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VSIG10Q8N0Z9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms