Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RPAP2Q8IXW5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RPAP2Q8IXW5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms