Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUDCD3Q8IVD9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NUDCD3Q8IVD9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms