Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTOP3Q7RTS5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
OTOP3Q7RTS5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243.9 ms