Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRADAQ7RTN6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms