Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC149Q6ZUS6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC149Q6ZUS6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms