Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM43Q6ZSC3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM43Q6ZSC3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM43Q6ZSC3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM43Q6ZSC3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM43Q6ZSC3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM43Q6ZSC3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RBM43Q6ZSC3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RBM43Q6ZSC3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBM43Q6ZSC3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms