Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMK1

CYHR1, Cysteine and histidine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYHR1Q6ZMK1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CYHR1Q6ZMK1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYHR1Q6ZMK1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYHR1Q6ZMK1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYHR1Q6ZMK1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYHR1Q6ZMK1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYHR1Q6ZMK1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYHR1Q6ZMK1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CYHR1Q6ZMK1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYHR1Q6ZMK1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYHR1Q6ZMK1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CYHR1Q6ZMK1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYHR1Q6ZMK1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYHR1Q6ZMK1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYHR1Q6ZMK1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYHR1Q6ZMK1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYHR1Q6ZMK1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYHR1Q6ZMK1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYHR1Q6ZMK1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CYHR1Q6ZMK1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYHR1Q6ZMK1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYHR1Q6ZMK1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYHR1Q6ZMK1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYHR1Q6ZMK1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYHR1Q6ZMK1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYHR1Q6ZMK1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYHR1Q6ZMK1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CYHR1Q6ZMK1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms