Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SFT2D3Q587I9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SFT2D3Q587I9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms