Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TPRNQ4KMQ1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TPRNQ4KMQ1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms