Protein–RNA interactions for Protein: Q4JDL3

PTPN20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN20Q4JDL3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN20Q4JDL3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN20Q4JDL3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN20Q4JDL3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN20Q4JDL3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN20Q4JDL3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN20Q4JDL3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN20Q4JDL3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN20Q4JDL3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN20Q4JDL3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPN20Q4JDL3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPN20Q4JDL3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPN20Q4JDL3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN20Q4JDL3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN20Q4JDL3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN20Q4JDL3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN20Q4JDL3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN20Q4JDL3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN20Q4JDL3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN20Q4JDL3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN20Q4JDL3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN20Q4JDL3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN20Q4JDL3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN20Q4JDL3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN20Q4JDL3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN20Q4JDL3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN20Q4JDL3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN20Q4JDL3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN20Q4JDL3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN20Q4JDL3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN20Q4JDL3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN20Q4JDL3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPN20Q4JDL3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms