Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNF260Q3ZCT1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ZNF260Q3ZCT1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ZNF260Q3ZCT1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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