Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ANKRD55Q3KP44 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD55Q3KP44 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms