Protein–RNA interactions for Protein: Q16647

PTGIS, Prostacyclin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGISQ16647 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTGISQ16647 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTGISQ16647 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms