Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKD1Q15139 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKD1Q15139 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
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