Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SCARF1Q14162 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCARF1Q14162 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
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