Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A6Q14031 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
COL4A6Q14031 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COL4A6Q14031 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
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