Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TCIRG1Q13488 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCIRG1Q13488 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
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