Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 SET6YPL165C 1122 nt4.51□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 SUI3YPL237W 858 nt4.51□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 GDE1YPL110C 3672 nt4.51□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 THI7YLR237W 1797 nt4.5□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 GSM1YJL103C 1857 nt4.5□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.5□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.5□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.5□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.5□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.5□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.5□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.5□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.5□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.5□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.5□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.5□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.5□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.5□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.5□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 FMP46YKR049C 402 nt4.5□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 SPC24YMR117C 642 nt4.5□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 YBL077WYBL077W 432 nt4.5□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 YBR134WYBR134W 402 nt4.5□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 ARC40YBR234C 1155 nt4.5□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 CDC48YDL126C 2508 nt4.5□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 EAR1YMR171C 1653 nt4.5□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 TIF4632YGL049C 2745 nt4.5□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 FLO8YER109C 2400 nt4.5□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 AVT1YJR001W 1809 nt4.49□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 FMP30YPL103C 1407 nt4.49□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 JHD2YJR119C 2187 nt4.49□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 RXT3YDL076C 885 nt4.49□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.49□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 ARD1YHR013C 717 nt4.49□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 SAE3YHR079C-A 276 nt4.49□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 KTR2YKR061W 1278 nt4.49□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 YNR068CYNR068C 819 nt4.49□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 YOL050CYOL050C 321 nt4.49□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 CBP3YPL215W 1008 nt4.49□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 IMA3YIL172C 1770 nt4.48□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 IMA4YJL221C 1770 nt4.48□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 PER1YCR044C 1074 nt4.48□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 MED2YDL005C 1296 nt4.48□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 snR7-SsnR7-S 179 nt4.48□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 DAS2YDR020C 699 nt4.48□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 PHO92YDR374C 921 nt4.48□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 KRE28YDR532C 1158 nt4.48□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 LOH1YJL038C 660 nt4.48□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 CNB1YKL190W 528 nt4.48□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 YIM2YMR151W 438 nt4.48□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 EGT2YNL327W 3126 nt4.48□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 PUT2YHR037W 1728 nt4.48□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 RSM23YGL129C 1353 nt4.48□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 ADY3YDL239C 2373 nt4.48□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 GCR1YPL075W 2358 nt4.48□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 SUL2YLR092W 2682 nt4.48□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 PAF1YBR279W 1338 nt4.47□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 DCV1YFR012W 609 nt4.47□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 TVP38YKR088C 1014 nt4.47□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 CTR1YPR124W 1221 nt4.47□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 OM14YBR230C 405 nt4.47□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 THS1YIL078W 2205 nt4.47□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 YHL012WYHL012W 1482 nt4.47□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 FRT2YAL028W 1587 nt4.47□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 SOF1YLL011W 1470 nt4.46□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 BNA6YFR047C 888 nt4.46□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 YGL193CYGL193C 312 nt4.46□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 CMR3YPR013C 954 nt4.46□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 IZH3YLR023C 1632 nt4.46□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 GIP4YAL031C 2283 nt4.46□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 NUP2YLR335W 2163 nt4.46□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 GLN4YOR168W 2430 nt4.45□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 PRP31YGR091W 1485 nt4.45□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 ENT1YDL161W 1365 nt4.45□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 NUP42YDR192C 1293 nt4.45□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 MCM21YDR318W 1107 nt4.45□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 MSA2YKR077W 1092 nt4.45□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 TIS11YLR136C 858 nt4.45□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 YLR407WYLR407W 687 nt4.45□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 PEX12YMR026C 1200 nt4.45□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 snR34snR34 203 nt4.45□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 OLE1YGL055W 1533 nt4.45□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 RAD52YML032C 1416 nt4.45□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 ALG9YNL219C 1668 nt4.45□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 CDC9YDL164C 2268 nt4.44□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 SKG6YHR149C 2205 nt4.44□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 TGL1YKL140W 1647 nt4.44□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 EMG1YLR186W 759 nt4.44□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 MET4YNL103W 2019 nt4.44□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 RPN6YDL097C 1305 nt4.44□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 TAF12YDR145W 1620 nt4.43□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 FBP26YJL155C 1359 nt4.43□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 KIC1YHR102W 3243 nt4.43□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 CDC6YJL194W 1542 nt4.43□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 YCR050CYCR050C 309 nt4.43□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 API2YDR525W 330 nt4.43□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 YFL041W-AYFL041W-A 192 nt4.43□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 YGL101WYGL101W 648 nt4.43□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 BUD13YGL174W 801 nt4.43□□□□□ -1.7
VPS54Q12071 VMA22YHR060W 546 nt4.43□□□□□ -1.7
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