Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CENPEQ02224 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms