Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TNFRSF17Q02223 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms