Protein–RNA interactions for Protein: Q01813

PFKP, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, platelet type, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKPQ01813 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFKPQ01813 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFKPQ01813 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFKPQ01813 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFKPQ01813 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFKPQ01813 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PFKPQ01813 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFKPQ01813 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFKPQ01813 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFKPQ01813 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PFKPQ01813 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PFKPQ01813 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKPQ01813 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKPQ01813 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKPQ01813 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKPQ01813 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKPQ01813 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKPQ01813 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKPQ01813 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKPQ01813 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKPQ01813 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKPQ01813 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKPQ01813 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKPQ01813 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms