Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SCN7AQ01118 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCN7AQ01118 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCN7AQ01118 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms