Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SNRPFP62306 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPFP62306 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms