Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE2HP62256 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE2HP62256 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms